Сериал "Страх над Невой" разворачивает детективную историю в туманном Ленинграде 1967 года. По ночам у Обводного канала находят тела женщин, а рядом с ними — странные знаки, начертанные углем. Это дело поручают двум следователям из разных ведомств, майору госбезопасности Чубину и милицейскому капитану Фёдорову, которым предстоит объединить усилия в поимке неуловимого маньяка.
Чубин — человек со сложным прошлым, однажды уже столкнувшийся с чем-то иррациональным и заплативший за это душевным покоем. Теперь его преследуют призраки старых ошибок и иррациональный страх перед темнотой. Его новый напарник, Фёдоров, тоже несет свой груз — запутанные личные отношения, которые могут пошатнуть его принципы. Вместе они представляют собой не самую слаженную, но, возможно, единственную пару, способную докопаться до сути.
Их расследование превращается в гонку со временем под жёстким прессингом сверху. Каждая новая жертва усиливает напряжение в городе и давление на дуэт следователей, заставляя их не только искать убийцу в промозглых дворах, но и разбираться с собственными демонами, которые оказываются не менее опасными.